Filtre kullanım alanı göz önünde bulundurularak seçilir. Havalandırma sistemleri genellikle toz filtresi bulundurur. Ancak hastane odaları gibi hassas yerler daha farklı filtrelere ihtiyaç duyarlar. Ortamdan filtre edilecek partiküllerin yapısı da filtre seçiminde önemlidir. Ortam sıcaklığı fazla ise filtre sıcaklığa dayanıklı malzemeden yapılmış olmalıdır. Filtre edilecek partiküllerin yaklaşık boyutları da seçilecek filtrenin yapısında dikkate alınmalıdır. Yüksek basınç ve enerji kaybına yol açmamak için seçilecek filtrenin, filtrasyon verimi iyi belirlenmelidir. Gereksiz yere daha güçlü bir filtre gereksiz maliyet ve enerji kaybı getirir.
Filtrenin kullanılacağı yerin çevresel faktörleri göz önüne alınmalıdır. Aynı kapasitedeki bazı filtreler bazı ortamlarda verimli çalışamaz. Aşırı ısı ya da nem bulunan yerlerdeki filtre kullanımı faklı olur. Bu etkenlere dayanıklı filtreler seçilmelidir. Toz filtresi aparatları da bu durum göz önüne alınarak seçilir.

Havalandırma sistemlerinde kullanılan toz filtresi aparatları, havalandırma sisteminin basınç değerleri ile uyumlu olmalıdır. Aksi durumlarda sistemin performansı düşer. Toz filtresi ebatları da havalandırma sistemine uygun olarak seçilmelidir. Gereksiz enerji kaybı böylece önlenir. Filtrenin montaj ve temizlik kolaylığı da önemli bir faktördür. Sistemle tam uyumlu şekilde çalışacak montajı, temizliği ve bakımı kolay olacak bir toz filtresi seçilmelidir.